Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSSP48449 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSSP48449 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSSP48449 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSSP48449 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSSP48449 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSSP48449 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSSP48449 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSSP48449 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSSP48449 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSSP48449 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSSP48449 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSSP48449 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSSP48449 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LSSP48449 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LSSP48449 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LSSP48449 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSSP48449 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSSP48449 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms