Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNJ1P48048 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ1P48048 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms