Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB2P47870 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms