Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA2P47869 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms