Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPZBP47756 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms