Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN1BP46527 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms