Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP13P45452 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP13P45452 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP13P45452 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP13P45452 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP13P45452 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP13P45452 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP13P45452 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP13P45452 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP13P45452 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP13P45452 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP13P45452 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP13P45452 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP13P45452 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP13P45452 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP13P45452 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP13P45452 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP13P45452 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP13P45452 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP13P45452 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP13P45452 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP13P45452 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP13P45452 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP13P45452 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms