Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA3P43357 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms