Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCAMP43121 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCAMP43121 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCAMP43121 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCAMP43121 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCAMP43121 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCAMP43121 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCAMP43121 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCAMP43121 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCAMP43121 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCAMP43121 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCAMP43121 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCAMP43121 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCAMP43121 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MCAMP43121 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCAMP43121 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MCAMP43121 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCAMP43121 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCAMP43121 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCAMP43121 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCAMP43121 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCAMP43121 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCAMP43121 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCAMP43121 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCAMP43121 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCAMP43121 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCAMP43121 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCAMP43121 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCAMP43121 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCAMP43121 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCAMP43121 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCAMP43121 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCAMP43121 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms