Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A1P43005 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms