Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP2P42575 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP2P42575 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP2P42575 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP2P42575 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms