Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC19A1P41440 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms