Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5CP41229 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5CP41229 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5CP41229 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5CP41229 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5CP41229 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5CP41229 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5CP41229 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5CP41229 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms