Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHMBP2P38935 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms