Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATP6V1E1P36543 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1E1P36543 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms