Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM23P36406 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM23P36406 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms