Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKAP35790 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKAP35790 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKAP35790 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKAP35790 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHKAP35790 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHKAP35790 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHKAP35790 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHKAP35790 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHKAP35790 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHKAP35790 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHKAP35790 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHKAP35790 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHKAP35790 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHKAP35790 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHKAP35790 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHKAP35790 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHKAP35790 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms