Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXD13P35453 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms