Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR5P32302 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms