Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR1P32246 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR1P32246 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR1P32246 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR1P32246 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR1P32246 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR1P32246 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCR1P32246 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR1P32246 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR1P32246 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR1P32246 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR1P32246 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms