Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRIP30626 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRIP30626 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRIP30626 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRIP30626 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRIP30626 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRIP30626 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRIP30626 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRIP30626 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRIP30626 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRIP30626 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRIP30626 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRIP30626 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRIP30626 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRIP30626 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRIP30626 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRIP30626 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRIP30626 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms