Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-FP30511 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms