Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND3P30281 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND3P30281 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND3P30281 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND3P30281 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND3P30281 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND3P30281 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND3P30281 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND3P30281 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND3P30281 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND3P30281 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND3P30281 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND3P30281 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND3P30281 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND3P30281 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND3P30281 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND3P30281 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND3P30281 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND3P30281 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND3P30281 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND3P30281 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND3P30281 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND3P30281 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND3P30281 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND3P30281 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND3P30281 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND3P30281 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND3P30281 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND3P30281 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND3P30281 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND3P30281 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND3P30281 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND3P30281 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND3P30281 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND3P30281 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms