Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARID4AP29374 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID4AP29374 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID4AP29374 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms