Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms