Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HMGB2P26583 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGB2P26583 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGB2P26583 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms