Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRBP23467 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRBP23467 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRBP23467 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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