Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYF6P23409 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
MYF6P23409 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYF6P23409 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYF6P23409 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYF6P23409 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MYF6P23409 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYF6P23409 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYF6P23409 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYF6P23409 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYF6P23409 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYF6P23409 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF6P23409 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF6P23409 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms