Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGFR4P22455 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR4P22455 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms