Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD247P20963 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD247P20963 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD247P20963 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD247P20963 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD247P20963 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD247P20963 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD247P20963 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CD247P20963 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD247P20963 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD247P20963 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD247P20963 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms