Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4BPBP20851 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BPBP20851 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms