Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1D1P20393 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms