Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB4AP20338 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms