Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CXCL3P19876 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms