Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM21P19474 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM21P19474 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms