Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS1P17812 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS1P17812 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms