Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6AP16499 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6AP16499 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms