Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFAP15692 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VEGFAP15692 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms