Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA1P15085 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA1P15085 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA1P15085 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA1P15085 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA1P15085 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA1P15085 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA1P15085 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms