Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB2P14652 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB2P14652 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB2P14652 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms