Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFAPP14136 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFAPP14136 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFAPP14136 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFAPP14136 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFAPP14136 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFAPP14136 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFAPP14136 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFAPP14136 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFAPP14136 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFAPP14136 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFAPP14136 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GFAPP14136 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFAPP14136 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFAPP14136 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFAPP14136 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GFAPP14136 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GFAPP14136 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GFAPP14136 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFAPP14136 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms