Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLS3P13797 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLS3P13797 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLS3P13797 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLS3P13797 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLS3P13797 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLS3P13797 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLS3P13797 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLS3P13797 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLS3P13797 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLS3P13797 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLS3P13797 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLS3P13797 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLS3P13797 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PLS3P13797 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLS3P13797 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLS3P13797 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLS3P13797 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLS3P13797 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms