Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCP1P13796 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCP1P13796 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCP1P13796 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCP1P13796 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCP1P13796 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCP1P13796 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCP1P13796 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LCP1P13796 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCP1P13796 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCP1P13796 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCP1P13796 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LCP1P13796 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCP1P13796 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCP1P13796 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCP1P13796 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCP1P13796 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCP1P13796 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCP1P13796 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCP1P13796 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCP1P13796 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCP1P13796 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCP1P13796 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCP1P13796 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCP1P13796 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms