Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRG2P13727 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRG2P13727 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRG2P13727 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRG2P13727 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRG2P13727 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRG2P13727 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRG2P13727 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRG2P13727 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRG2P13727 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PRG2P13727 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PRG2P13727 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRG2P13727 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRG2P13727 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRG2P13727 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRG2P13727 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.8 ms