Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL5P13501 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL5P13501 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL5P13501 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL5P13501 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL5P13501 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL5P13501 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL5P13501 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL5P13501 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL5P13501 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL5P13501 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL5P13501 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL5P13501 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL5P13501 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL5P13501 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL5P13501 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL5P13501 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL5P13501 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL5P13501 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL5P13501 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL5P13501 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL5P13501 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL5P13501 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL5P13501 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL5P13501 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL5P13501 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL5P13501 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL5P13501 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL5P13501 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL5P13501 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL5P13501 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL5P13501 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL5P13501 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL5P13501 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL5P13501 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL5P13501 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL5P13501 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL5P13501 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL5P13501 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL5P13501 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL5P13501 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL5P13501 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL5P13501 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL5P13501 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms