Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH1P12830 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH1P12830 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH1P12830 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH1P12830 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH1P12830 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH1P12830 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH1P12830 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH1P12830 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH1P12830 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH1P12830 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH1P12830 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH1P12830 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH1P12830 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH1P12830 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH1P12830 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH1P12830 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH1P12830 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH1P12830 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH1P12830 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH1P12830 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms