Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRFP11831 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRFP11831 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRFP11831 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRFP11831 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRFP11831 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRFP11831 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRFP11831 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRFP11831 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRFP11831 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRFP11831 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRFP11831 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRFP11831 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRFP11831 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRFP11831 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRFP11831 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRFP11831 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRFP11831 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRFP11831 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRFP11831 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRFP11831 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRFP11831 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRFP11831 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRFP11831 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRFP11831 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRFP11831 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRFP11831 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRFP11831 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRFP11831 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRFP11831 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRFP11831 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRFP11831 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRFP11831 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms