Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ESRRAP11474 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ESRRAP11474 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms