Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2P10911 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2P10911 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2P10911 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2P10911 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2P10911 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2P10911 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCF2P10911 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCF2P10911 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCF2P10911 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCF2P10911 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2P10911 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2P10911 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2P10911 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2P10911 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2P10911 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2P10911 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2P10911 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCF2P10911 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCF2P10911 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCF2P10911 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCF2P10911 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCF2P10911 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms