Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARAP10276 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARAP10276 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARAP10276 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARAP10276 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARAP10276 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARAP10276 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARAP10276 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARAP10276 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARAP10276 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RARAP10276 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARAP10276 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARAP10276 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARAP10276 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARAP10276 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARAP10276 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARAP10276 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARAP10276 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARAP10276 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RARAP10276 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms